Héraclius se déroule au VIIe siècle, dans l'empire romain d'Orient. Un usurpateur a pris le pouvoir en exterminant les héritiers mâles de l'empereur, deux nourrissons ont été sauvés; vingt ans plus tard, ils croiront tous deux être Héraclius, l'héritier légitime du trône. Corneille donne à réfléchir sur l'ambiguïté des apparences, la quête de l'identité et la légitimité du pouvoir.