En 2075, la conquête spatiale a fait d'énormes progrès. Une colonie minière s'est notamment établie sur la Lune et une mission vers Jupiter se prépare. Mais toute cette activité a entraîné l'augmentation des débris en orbite autour de la Terre. Leur collecte a donné naissance à un nouveau métier : les éboueurs de l'espace.

Entre attentats terroristes, angoisse existentielle et relations humaines compliquées, Planetes suit le quotidien de Hachimaki , un Japonais qui rêve de posséder son propre vaisseau, Yuri , un Russe hanté par la mort de sa femme, et Fi , une Américaine colérique qui a laissé sa famille sur Terre.