Que s'est-il passé pendant les mille ans de sommeil de Kaname ?

Tandis que le monde, jusque-là déchiré par le conflit sanglant entre humains et vampires, connaissait une brève période d'accalmie, Kaname continuait de sommeiller dans son cercueil de glace. Le temps s'est écoulé, et mille ans après les événements de Vampire Knight , Yûki a choisi d'offrir sa vie à Kaname pour qu'il revienne à la vie en tant qu'humain. L'heure est venue de découvrir les histoires qui se sont déroulées entre-temps.