A la suite d'un accident, Black Jack a été défiguré et porte deux moitiés de visage, l'une noire, l'autre blanche. Surnommé le chirurgien de l'impossible, il consacre désormais sa vie à sauver celle des autres. Les gens font appel à lui quand tout espoir a disparu ou pour garder le secret sur les maladies des personnalités importantes.