Le jeune lycéen Arata s'est soudainement retrouvé dans un monde lointain étrange et mythique. Aussitôt accusé du meurtre de la princesse de ce monde, il s'empare, afin de se défendre, d'une épée divine Hayagami qu'il trouve par hasard à portée de main. Tout de suite, l'arme semble l'avoir choisi pour qu'il en devienne le propriétaire. Mais Arata est finalement arrêté.