La qualité du milieu vivant, ou plutôt son état de santé, ne s'appréhende que grâce à des méthodes susceptibles de rendre une réponse globale, intégrant un maximum de paramètres représentatifs du milieu. Les méthodes biologiques qui, elles-mêmes, reposent sur la mesure de différentes variables sont susceptibles d'apporter cette réponse intégrée.