1382 :

Après mille péripéties, Nicolas Flamel, libraire-copiste, découvre le secret des transmutations des métaux vils en or. À la mort de l'alchimiste, en 1418, Roland, son fils spirituel, se fait assassiner par des malandrins qui le dépouillent de la formule magique. Le manuscrit se retrouve dans les caves du Vatican. Les siècles passent...

De nos jours :

Un hacker, commandité par une secte, parvient à percer les archives du Vatican pour dérober le manuscrit.

L'archiviste du Vatican mandate un mercenaire pour retrouver le voleur. Parallèlement, un couple part en week-end d'amoureux, pour Malte. Ils vont être mêlés à cette sombre histoire de manuscrit, sans vraiment imaginer l'issue tragique de leur périple.

Les deux histoires, qui, à priori, n'ont rien à voir entre elles, s'entremêlent et donnent lieu à de multiples rebondissements.