La suite des aventures de Hinata Harusawa, qui apprend que le corps de son meilleur ami, Sora Otonashi, disparu lorsqu'ils étaient en deuxième année de lycée, a été retrouvé. En observant la toile que ce dernier a peinte avant sa disparition, l'un de ses amis remarque un détail intrigant, et se fait immédiatement attaquer par un inconnu.