Les œuvres égyptiennes sont présentées à travers différentes sections : la faune et la flore, la religion et les sites culturels majeurs, le culte des morts, les institutions, la diffusion des cultes égyptiens dans le monde romain à l'époque impériale, l'Egypte copte et l'Egypte musulmane et Egyptomania : le goût des Français pour l'Egypte aux XVIIIe et XIXe siècles.