Un groupe de trois chercheurs français et leur assistant sont envoyés par Louis Pasteur à Alexandrie, en 1883, pour identifier le microbe du choléra, épidémie qui frappe la cité égyptienne. Louis Thuillier, Emile Roux et Edmond Nocard sont en concurrence avec l'Allemand Robert Koch. Ils découvrent la société alexandrine et rencontrent Este, une jeune fille qui s'intéresse à leurs recherches.