A la recherche de Tommy Oliver, le Ranger vert, les Power Rangers débarquent à New York et trouvent ce dernier aux prises avec les Tortues ninja. Ils ne tardent pas à découvrir que Tommy s'est associé avec Shredder et son terrible clan Foot. Ils doivent faire équipe avec les fils de Splinter pour le ramener à la raison et empêcher la destruction du monde.