Alors que Mikoto s'apprête à se laisser abattre par Accelerator pour fausser les calculs du diagramme arborescent, Tôma

décide d'aller lui-même affronter l'esper. Grâce à l'Imagine Breaker et à l'aide des sisters, il parvient à le mettre en difficulté !

Sa victoire sonne le glas de l'expérience : les clones de Mikoto sont libérés et reçoivent un traitement médical. Mais tandis que

la fin des vacances arrive à grands pas, de nouveaux adversaires viennent bouleverser le quotidien du jeune lycéen...