En 1693, le père jésuite Yves de la Croix, explorateur au service de Louis XIV, ramène à Versailles un couple de créatures marines capturées dans les mers du Nouveau Monde. Aidé par sa jeune soeur, il cherche à percer les mystères du chant de ces sirènes et pour cela doit se battre contre l'ambition de la cour et l'obscurantisme chrétien.