Il y a bien longtemps, dans une galaxie lointaine, très lointaine...

Dix ans après Star Wars Épisode I : La Menace fantôme , la galaxie est au bord de l'implosion. Le Comte Dooku, un ancien Sith tombé du côté obscur et qui officie sous le nom de Dark Tyrannus, est à la tête du mouvement Séparatiste qui amène des milliers de systèmes planétaires à faire sécession de la République Galactique. Padmé Amidala est visée par une tentative d'assassinat. Deux Chevaliers Jedi sont missionnés auprès d'elle afin de la protéger, Obi-Wan Kenobi et son Padawan, un certain Anakin Skywalker...