Dans les eaux tropicales de la Grande Barrière de corail, Marin, un poisson-clown, mène une vie paisible avec son fils unique, Nemo. Redoutant l'océan et ses risques imprévisibles, Marin fait de son mieux pour protéger son fils. Mais, comme tous les petits poissons de son âge, celui-ci rêve pourtant d'explorer les mystérieux récifs...