L'équipe de Gantzers nipponne est téléportée dans le vaisseau mère des envahisseurs.

Malheureusement, en dépit de ripostes téméraires et de nombreuses victimes, l'invasion extraterrestre poursuit son cours.

Découvrant que Taé a été enlevée par l'ennemi, Keï Kurono décide de s'infiltrer à nouveau dans le gigantesque vaisseau mère pour sauver sa bien-aimée.

Les humains qu'il libérera au cours de ses recherches élèveront alors le jeune homme au rang de dernier espoir de l'humanité...