Après des études de droit et de lettres, Pierre Aubert passe le concours de chef de cabinet puis est nommé dans l'Hérault et la Somme. Sous-préfet à Vouziers sous l'Occupation, il devient, après la Libération, préfet de l'Aveyron, de l'Indre et du Jura. Il termine sa carrière comme secrétaire général de la préfecture de police à Paris.