Pendant l'attaque de la ville de Shimoto par Mr Z., le Tengu légendaire, le professeur Takama et sa créature, la fausse Shinobu, disparaissent. Shinobu tente de renouer avec son passé d'être humain. Elle s'installe avec le jeune Jun'ichi sur l'île d'Hokkaïdo. Mais quand elle apprend la tentative de prise de pouvoir de Mr Z. à Tokyo, elle choisit son camp...