Dans le premier épisode Peter Parker doit faire face aux attaques du Zodiaque. Dans le deuxième, Spider-Man vient en en aide au jeune Miles Morales, le nouveau Spider-Man, alors que le démon Blackheart passe à l'attaque. Dans le troisième, après la mort de Tempest, Miguel O'Hara, prisonnier du présent, hésite à endosser à nouveau le costume du Spider-Man de 2099.