Le White Base, un transporteur spatial militaire avec à son bord des rescapés civils de la colonie Side 7, est en situation critique. Alors qu'il se dirige vers la Terre, pour atterrir en Amérique du Sud, son équipage fait face à Char, le membre le plus redoutable des forces de Zeon. Le jeune Amuro, pilote de Gundam, un prototype secret de robot aux capacités incroyables, leur vient en aide.