Mademoiselle Shiki Magata est un cerveau. Ses dons pour l'informatique sont tels qu'elle vit cachée dans un centre de recherche sur une petite île ultra protégée. Un jour, elle est pourtant assassinée et le mystère du crime reste entier. Une solide enquête menée par le professeur Saikawa et son élève Moé, permettra de révéler l'incroyable vérité sur Shiki et les dessous d'une affaire peu commune.