Dans un Japon mi-médiéval, mi-futuriste, des extraterrestres appelés Amanto envahissent la Terre et décident d'imposer leur loi : tout samouraï doit se défaire de son sabre. Cependant, un obstacle de taille se dresse devant eux : Gintoki Sakata, une tête brûlée qui n'a peur de rien. Armé de son sabre d'entraînement, il se place en dernier défenseur du bushido, le code du samouraï.