Tetsurô et Maetel poursuivent leur voyage vers Ultimate afin de contrecarrer les plans des Métanoïdes, des êtres dont la structure cellulaire est métallique et qui veulent exterminer toutes les formes de vie organique. Le chemin paraît long et semé d'embûches. Mais bientôt, Albator et Emeraldas qui font route vers la même destination vont leur venir en aide.