Central City est, plus que jamais, le centre d'un obscur complot. Le colonel Mustang voit son unité démantelée tandis qu'Edward et Alphonse doivent faire face au géniteur des homonculus. Pour découvrir les procédés de fabrication de Fullmetal alchemist avec un carnet de croquis qui dévoile la façon dont les différents personnages ont été créés.