1596 est encore une année difficile pour T. de Bèze. Le roi Henri IV, embarrassé dans une guerre incertaine contre l'Espagne, a laissé tomber le projet de paix avec la Savoie, dont dépend la paix pour Genève. Bèze n'enseigne plus et ne peut presque plus sortir de chez lui. Il a préparé une nouvelle édition de son Nouveau Testament in-folio ainsi que de ses poèmes.