À 27 ans, Sam Flynn est expert en technologie. Cherchant à percer le mystère de la disparition de son père, Kevin Flynn, il se retrouve aspiré dans un redoutable programme de jeux, où vit son père, enfermé depuis 25 ans. Père et fils s'engagent alors dans un combat où le danger rôde, à travers un cyber-univers époustouflant, plus avancé technologiquement et plus dangereux que jamais...