En 2043, un parasite inconnu, Baby, transforme les personnes en monstres mécaniques, mettant l'humanité en danger. A Taïwan, Elisa survit à l'attaque de l'un de ces mutants mais un Baby s'introduit dans sa main. Un an plus tard, alors qu'elle ne s'est pas transformée en hybride, elle quitte la ville. Elle croise des chercheurs qui doivent ramener une certaine Alice au sanctuaire des humains.