Secrets intimes nous plonge au coeur d'un drame familial mêlé à une intrigue policière. Après avoir arrêté un délinquant récidiviste, le commissaire Antoine Blanchet est assassiné chez lui avec sa femme Josiane. Le commissaire Stéphane Donatelli, son beau-frère, doit le remplacer. Il fait la connaissance de son coéquipier Guy Morel qui doit l'assister dans cette enquête...