En 2014, le lycéen Akira Natsume est victime d'un accident de voiture et, lorsqu'il se réveille en 2030, il n'est plus qu'un « cerveau » blindé.

Ayant besoin de ses talents de hackeur hors pair en tant qu'« ex-arm n° 00 », « la section anti ex-arm » de la police - où travaillent Minami et Alma - fait appel à ses services. C'est alors qu'« une maison close de sexoïdes » est attaquée ! C'est Je début d'une longue série de crimes impliquant des ex-arms !