Une menace fantôme vient perturber le fonctionnement d'une étrange machine dans le fond d'une grotte. Le déclencheur au réveil d'Amaterasu, la dernière phase. Ainsi qu'à celui d'une vengeance froide et meurtrière. C'est ici que tout commence... Pendant que, plus loin dans le désert, un jeune adolescent amnésique ère à la recherche d'une femme qu'il voit en rêve...