Janvier 1386. Les Atlantes sont là. Depuis des millénaires, ils vivent au milieu des hommes et le moment est venu pour eux de se révéler et de prendre le pouvoir.

De Fougères à Brocéliande, Malo, Ewann et Eloane partent à la recherche de la deuxième pierre, un de ces artefacts capables de vaincre les Atriades et de ramener la paix. Le jeune Atlante espère bien également retrouver son frère. Mais leur ennemi juré, Tarxos, après son échec au Mont Saint-Michel, est bien décidé à prendre sa revanche.

De rencontres en découvertes, Malo et ses amis vont se rapprocher un peu plus de la vérité sur l'Atlantide.