En 2048 dans un Tokyo où règnent le terrorisme et le crime, l'androïde Origin refuse de laisser faire les androïdes hostiles aux humains qui commettent des meurtres la nuit. Origin, Laura Fermi et Mai Hirose sont au centre de recherche en intelligence artificielle de Kyôto au moment où Gon décide de l'attaquer avec l'objectif de ne pas laisser de survivants. Origin doit trouver de l'aide.