Après La Cathédrale céleste, La Naissance d'Hermès voit la petite communauté de spationautes s'organiser sur la Lune, futur lieu de transit entre la Terre et Mars. Afin de paver le chemin d'autres explorateurs, il s'agit de planifier l'habitat extra-terrestre, construire une base permanente, cartographier la surface lunaire et en analyser les minéraux, envisager l'exploitation des astéroïdes...