Bacon se consacra alors entièrement à l'activité scientifique et philosophique qu'il avait toujours menée. Sa vision rationaliste et inductive du raisonnement scientifique eut une postérité jusqu'au XIX^e siècle positiviste, chez Comte et Darwin, mais il est aussi un des héros de Nietzsche. Dans les Essais de morale et de politique sa méthode le rapproche des moralistes antiques. Les affaires humaines sont froidement disséquées et d'un coup de scalpel Bacon en révèle l'essence même.