Après avoir été le cobaye de la société Umbrella Corporation qui pensait l'affaiblir, Alice est de retour, plus forte que jamais et farouchement décidée à punir ses tortionnaires. Dans cette nouvelle aventure, elle est aidée par deux survivants du virus qui a ravagé la ville : Carlos Olivera et Claire Redfield, qui est à la tête d'une petite armée d'humains.