Le trésor de Conques aurait sans nul doute disparu, comme la plupart des trésors d'église, si un second vol n'était venu sceller différemment l'histoire. En 1794, alors que la République naissante réquisitionnait tous les objets de métaux précieux pour les fondre, la commune de Conques, profitant de son éloignement, fit la sourde oreille aux injonctions administratives. Une nuit d'orage, un petit groupe d'habitants mené par quelques ecclésiastiques fractura la porte de l'église et celle de l'armoire des reliques pour simuler un vol.

Toutes les pièces du trésor furent emportées en catimini et cachées dans des abris précaires : conduits de cheminées, séchoirs à châtaignes, greniers. Quelques années plus tard, la menace passée, le trésor de Conques réapparut et reprit sa place dans le sanctuaire.