Septembre 2063, Raphaël intègre le Collège, un établissement qui forme les futurs psychoagents. Son pouvoir le rend invisible aux yeux de tous et il devient le Fantôme pour les autres élèves. Avec ses amis Younès, Alyssa et Malaury, il enquête sur la disparition de nombreux élèves et suspecte le Réseau, une puissante organisation malfaisante, d'être responsable des enlèvements.