Les travaux de l'auteur réunis ici visent à mettre en question un certain nombre de lieux communs très répandus : Bayle adepte du dualisme cartésien et de l'occasionalisme malebranchiste ; Bayle héritier de la doctrine protestante des droits de la conscience ; Bayle sceptique à l'égard de la raison humaine et tenant d'un fidéisme calviniste irréprochable.