Cette saga met en scène les élèves d'une école de magie dans un univers futuriste, dominé par les nouvelles technologies. En 2095, Tatsuya Shiba et sa jeune soeur Miyuki ont rejoint l'école. Alors que l'un est relégué au rang des élèves médiocres, l'autre est vue comme une véritable surdouée. Mais bientôt, des complots et des menaces se mettent en place.